郑华国 https://m.39.net/disease/a_5464393.html<
原创上海疾控上海疾控
那个
在11月23日的新闻发布会上，上海市疾控中心通报了病例的相关情况。据介绍，11月9日上海确诊的新冠肺炎病例王某某，及11月10日在安徽确诊的关联病例兰某，两病例所感染的病毒基因高度同源，且与北美流行株高度相似，提示感染来源为境外输入。
看到这里大家是不是一头雾水，基因高度同源是什么意思？病毒基因与北美流行株高度相似是怎么发现的？
疾控君这就科普一下，为什么通过基因测序可以帮助我们发现感染的可疑来源。
什么是全基因组测序
生命体的遗传物质分两种：核糖核酸（RNA）和脱氧核糖核酸（DNA）。新冠病毒的遗传物质是RNA，它是由4种大分子（也就是碱基）串联成的一条链，这四种分子按一定的顺序交替排列，被称为序列，不同位置开始的、具有特殊功能的特定长度的序列就是基因。
说人话，新冠病毒就像一条手链，可以由不同的珠子串起来，手链上的每颗珠子都是具有特殊功能的基因。当把珠子放大，就会发现每颗珠子都是由四种碱基紧密排列组成的。所以，基因测序就是先发现珠子，再放大看其中的碱基是怎么排列的；当把碱基排列情况看清楚时，就可以完全测定出来新冠病毒的核酸序列。
新冠病毒这条“手链”的长度为（约3万）个碱基。在以前技术不是那么发达的时候，技术人员测定整个基因组可能要耗费数周甚至数月的时间。随着科学技术的发展，凭借全基因组测序技术，可以一次性完成之前数月的工作。当然，这项技术操作起来比较复杂，不仅仅需要在实验室里进行，还需要高性能计算机，至少分析数小时才能完成。
图：新冠病毒基因组的构成
（图片来自GISAID
