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TUhjnbcbe - 2024/9/14 17:41:00
郑华国 https://m.39.net/disease/a_5464393.html
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在11月23日的新闻发布会上,上海市疾控中心通报了病例的相关情况。据介绍,11月9日上海确诊的新冠肺炎病例王某某,及11月10日在安徽确诊的关联病例兰某,两病例所感染的病毒基因高度同源,且与北美流行株高度相似,提示感染来源为境外输入。

看到这里大家是不是一头雾水,基因高度同源是什么意思?病毒基因与北美流行株高度相似是怎么发现的?

疾控君这就科普一下,为什么通过基因测序可以帮助我们发现感染的可疑来源。

什么是全基因组测序

生命体的遗传物质分两种:核糖核酸(RNA)和脱氧核糖核酸(DNA)。新冠病毒的遗传物质是RNA,它是由4种大分子(也就是碱基)串联成的一条链,这四种分子按一定的顺序交替排列,被称为序列,不同位置开始的、具有特殊功能的特定长度的序列就是基因。

说人话,新冠病毒就像一条手链,可以由不同的珠子串起来,手链上的每颗珠子都是具有特殊功能的基因。当把珠子放大,就会发现每颗珠子都是由四种碱基紧密排列组成的。所以,基因测序就是先发现珠子,再放大看其中的碱基是怎么排列的;当把碱基排列情况看清楚时,就可以完全测定出来新冠病毒的核酸序列。

新冠病毒这条“手链”的长度为(约3万)个碱基。在以前技术不是那么发达的时候,技术人员测定整个基因组可能要耗费数周甚至数月的时间。随着科学技术的发展,凭借全基因组测序技术,可以一次性完成之前数月的工作。当然,这项技术操作起来比较复杂,不仅仅需要在实验室里进行,还需要高性能计算机,至少分析数小时才能完成。

图:新冠病毒基因组的构成

(图片来自GISAID

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